После долгих исследований было выяснено, что данная ситуация возникает в случае отсоединения Ethernet-кабеля от адаптера подключеного к регистратору.
Причина, оказалось, в следующем:
При опросе счетчиков, МУР должен открыть маршрут через Ethernet-адаптер. Для этого он настраивает канал, к которому подключен этот адаптер, на его интерфейсную скорость. В данном случае скорости адаптера и дополнительного канала МУРа не совпали: у адаптера - 19200бод BIN, а у МУРа – 38400бод ASCII. В случае пропадания связи между адаптерами, регистратор делает несколько попыток (по умолчанию в маршруте для Ethernet-адаптеров устанавливается 3 попытки со временем ожидания - 20000мс). Получилось так, что МУР почти не выходит из состояния попытки открытия маршрута и не перестраивает доп-канал на связь с компьютером.
Проблема может быть решена путем уменьшения количества попыток открытия маршрута, уменьшения таймаута открытия маршрута и по возможности увеличения времени ведения периодической базы.